请教node.js里有没有可以用来备份MongoDB的库，或者备份思路，BAE线上的MongoDB没法备份

楼主可以考虑mongoDB中的主从复制。这里篇幅有限，楼主可以Google之，自己去尝试才能有更好的掌握 ：)

主从复制吧 或者数据export 推荐用robomongo 觉得这个manager比较好用 可以跨server拷贝数据